После победы над Оригиналом и его армией КваКов, жители Мобиуса разошлись по своим делам, и в мире снова наступило тихое и скучное время. Но Соник не намерен мириться с тем, что его лучший друг бесследно потерян в неизвестности пространства и времени, и возвращается к доктору Роботнику... и оказывается втянут в очень подозрительную экспедицию к глубинам планеты, спровоцированную самим Тейлзом...